Upravni odbor
Upravni odbor broj pet članova koje imenuje Osnivač na period od četiri godine s mogućnošću reizbora. Dva člana Instituta imenuju se iz reda zaposlenih u Institutu s naučnim ili istraživačkim zvanjem.
Upravni odbor Instituta za bošnjačke studije čine:
Vijeće Instituta
Naučno vijeće Instituta je naučno-stručni organ sastavljen od najmanje pet članova. Naučno vijeće u pravilu čine zaposlenici Instituta sa naučnim stepenom doktora nauka. Naučno vijeće može imati i članove spoljne saradnike koji imaju naučni stepen doktora nauka.
Naučno vijeće kao naučno-stručni organ ima sljedeće nadležnosti:
- Na prijedlog direktora imenuje predsjedavajućeg Vijeća,
- Na prijedlog direktora utvrđuje naučnoistraživačke programe rada i prati njihovu realizaciju,
- Vrši izbor u naučna i istraživačka zvanja,
- Utvrđuje izdavačku politiku Instituta,
- Na prijedlog direktora usvaja naučnoistraživačke projekte, daje smjernice i ocjenjuje kvalitet istih,
- Vrši druge poslove u skladu sa zakonskim propisima i pravilima Instituta.
Naučno vijeće Instituta za bošnjačke studije čine: